También llamados "Pokémon Edición Oro HeartGold" y "Pokémon Edición Plata SoulSilver", repasan la historia de la región de Johto de igual forma que el primer remake repasa la historia de Kanto. Aunque hay varios cambios en el argumento del juego, este sigue casi la misma historia que en las primeras versiones, Oro y Plata. Además se incluyen varias cosas que fueron exclusivas de la edición Cristal, como es la introducción de la historia de Eusine y Suicune. En estos nuevos juegos hay una nueva protagonista femenina: Lira, sustituyendo a Cris. Esta, si no es elegida como protagonista por el jugador, continuará haciendo el mismo papel de amigo que ya hiciera Maya en Diamante, Perla y Platino. El rival, al igual que en las anteriores versiones, seguirá siendo ese chico misterioso que está enfrente del laboratorio del profesor Elm al principio del juego.
Los juegos han sido puestos en venta el 12 de septiembre de 2009 en Japón, 4 de febrero de 2010 en Corea, y 14 de marzo de 2010 en América del Norte, el 25 de marzo de 2010 en Australia y 26 de marzo de 2010 en Europa.
La historia sigue el mismo rumbo que su predecesoras Pokémon Oro, Pokémon Plata y Pokémon Cristal, viajar por Johto y después visitar Kanto, pero con algunos cambios en el argumento.
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